肾囊肿的药物治疗，目前来说没有什么特效药针对肾囊肿让囊肿不长或者是消失。主要还是因为肾囊肿它主要是肾小管憩室形成的，跟年龄相关，可能是属于退行性的改变。而且肾囊肿它对身体没有什么太大的影响，即使是肾脏中有几个，两个、三个，甚至是五个、十个的小囊肿，它对肾功能以及生活都不会造成任何影响。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。
目前还没有治疗肾囊肿的药物。对于肾囊肿的处理，主要是根据囊肿大小、部位以及是否合并感染或者破裂等情况做出决断。囊肿＜五厘米，而且没有不适临床症状，可以定期观察，不用处理。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
肾囊肿可以引起肾脏皮质的破坏，影响肾脏功能。
囊肿增大压迫肾组织可引起血尿，并可诱发尿路感染、结石、梗阻及腹膜后出血，少数有恶变的可能。一部分肾脏肿瘤（如囊性肾癌）会因为肿瘤内部形成坏死。囊肿很大时，才会有腰部酸痛症状。当囊肿较大时或者有肾功能减退。囊肿有可能突然破裂,导致感染和病情加重,长期压缩周围的肾组织影响肾功能。
建议早发现早治疗，建议去医院请医生结合临床择期进行手术治疗，并注意个人卫生，保持心情舒畅，避免过度劳累，加强营养，忌食生冷油腻辛辣刺激性食物，忌烟酒。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。