肾萎缩是由一组由多种原因包括慢性肾炎引起的临床症群，临床表现为大量蛋白尿、严重水肿、低蛋白血症和高脂血症。一般治疗是针对浮肿严重和低蛋白血症，患者应该卧床休息，低盐饮食，控制入水量和高蛋白饮食。西医治疗，一般采用糖皮质激素、利尿剂、免疫抑制剂等方法来治疗，但是会给人身体带来很大的副作用，建议到医院做详细的检查在根据医嘱用药，切勿乱用药其实肾萎缩发病的原因主要就是免疫引起的。
给予降全身的血压以及肾小球囊内压，选用ACEI和ARB类降压药，不同肾功能以及并发症的状况，给予辨证施治中药，给予结肠透析。如果结肠透析保守治疗还不行，肌酐已经达到尿毒症的状态，出现消化道症状、高钾血症等，需要血液透析、腹膜透析，进一步清除毒素。
肾脏萎缩一般都是各种原因导致的慢性肾脏疾病，是一个逐渐进展的过程。比如肾动脉狭窄，肾结核或者高血压肾病、糖尿病肾病或者慢性肾炎，病程一般都是几年或者十几年，这些情况都是不能改善或者治愈的，治疗的目的在于延缓萎缩的程度和幅度，延缓肾功能恶化的速度，尽可能的保持健存的肾单位能够完成肾脏的排水和排毒功能，避免过早进入尿毒症阶段。
常见的就是肾动脉狭窄，如果肾功能还残存不少，可以在其中放入支架来改善肾脏的血液供应。肾脏萎缩提示肾的功能已经下降，但是具体还有多少，还有没有治疗价值，需要行双肾ECT检查。
已经缩小的部分是不能恢复的，治疗病因来延缓肾萎缩，常见的原因是慢性肾小球肾炎，早期的慢性肾小球肾炎，往往需要使用激素或者是激素联合免疫抑制剂治疗。如果是糖尿病肾病，需要控制血糖。如果是高血压肾病，需要控制血压。如果是泌尿系统结石引起的问题，需要可能需要手术祛除结石。