如果囊肿较小，直径小于5cm，无肾实质或肾盂明显受压，无感染、恶变，患高血压的人都不主张手术，可定期检查。如果囊肿较大，直径大于5cm，或有明显压迫肾脏、感染等表现，则应行手术治疗。
肾囊肿一般大于4厘米才需要处理，肾囊肿相当于肾脏上面长了一个水泡，当肾囊肿大于4厘米的时候，建议可以到医院选择手术治疗。比较常用的手术方式是腹腔镜下肾囊肿去顶减压术，这种手术方式属于微创手术，主要是将肾囊肿的顶壁去除，然后将里面的囊液引流出来。
早期肾囊肿没有症状，不会出现身体的不适，不需要治疗，只需要每6个月到12个月复查一次就可以，出现症状或囊肿较大时，一般才用手术治疗，可以基本控制疾病，当前医学水平还没有治疗肾囊肿的特效方法。
肾囊肿可单发或者多发，常见于男性，可压迫血管或者引发尿路梗阻出现病症，可有腰腹背部间歇性钝痛，继发感染可出现尿频尿急等症，B超，ct检查可诊断，手术治疗是有效办法。就诊肾脏外科检查治疗，适当补充高纤维、高维素食物，多吃新鲜蔬果，忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品。
肾囊肿穿刺硬化治疗是治疗肾囊肿的一种比较好的方法，它就是在b超的引导下，经皮肾穿刺进入囊腔内，将囊腔内的液体抽出，然后按照一定的比例将95%的无水酒精或者其他的硬化剂注入囊壁内，通过充分的灌洗将肾囊肿的囊壁黏膜进行破坏，减少囊壁的分泌功能，通过这种治疗可以减轻囊肿的进度，可以使囊肿缩小，囊肿的分泌功能减退，从而抑制囊肿进一步的增大，达到治疗效果。
肾囊肿一般大于4cm才需要处理，肾囊肿相当于肾脏上面长了一个水泡，当肾囊肿大于4cm的时候，可以选择手术治疗。手术方式是腹腔镜下肾囊肿去顶减压术，这种手术方式属于微创手术，主要是将肾囊肿的顶壁去除，然后将里面的囊液引流出来。对于比较小的肾囊肿，一般不需要进行处理，可以进行复查，每半年做一次泌尿系彩超。