肾穿刺的适应症是各种原因导致的肾功能轻度异常，各种原因导致的蛋白尿和不明原因的血尿，以及临床诊断明确的急性肾炎，慢性肾炎及急进性肾炎等疾病，还可在原发性或者继发性肾病综合症的情况下，考虑做肾穿刺。
肾穿刺的适应症是各种原因导致的肾功能轻度异常，各种原因导致的蛋白尿和不明原因的血尿，以及临床诊断明确的急性肾炎，慢性肾炎及急进性肾炎等疾病，还可在原发性或者继发性肾病综合症的情况下，可以做肾穿刺。
患者做肾穿刺的原因有肾小球肾炎，肾功能减退较快者。或者临床表现不典型的原发性急性肾炎或急性肾炎数月后不愈或出现肾功能下降者。再或者急进性肾炎综合征，需行肾穿刺明确病理类型。还有就是)原因不明，考虑是继发于全身性疾病者。
需要做肾穿刺的情况、不典型急性肾小球肾炎病人需要做肾穿刺。急进性肾小球肾炎、原发性肾病综合征以及急性肾衰竭病人均需要做肾穿刺。对于肾移植肾功能减退原因不清，或者出现排异反应无法明确下一步治疗的也可以做肾活检。对于典型的急性肾小球肾炎病人，如果治疗以后不能缓解，发生急性肾衰竭时需要行肾穿刺活检。
做肾脏穿刺可以明确肾脏是否有癌性病变，脓肿，也可以明确肾炎等。一旦发现有占位性病变，可疑是癌症，就需要做肾脏穿刺，明确具体的病理类型。肾脓肿一般在三厘米以上的时候，可以考虑做穿刺排脓，小一点的脓肿可以保守治疗。对于各种类型的肾炎病人，当蛋白尿在两个加以上的时候，可以做肾脏穿刺，这样有助于明确具体肾炎的类型，以便对症治疗。