病毒性脑炎可能会给患者留下精神状态及认知功能异常的诸多后遗症。比如记忆力减退，理解能力和智力下降等。细菌性脑炎可能会出现意识、行为上的障碍，运动功能及视力也会有不同程度的下降。
脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
专科医院。这些个医院都是集国际、医疗、教学、科研、预防交流五位一体的三级甲等综合性医院。近几年来，医院也实现了跨越式发展，涌现了一批特色医疗项目，医院的整体规模也在不断的扩大。
手术治疗：手术治疗在小儿脑炎后遗症患儿的临床治疗中占有重要的地位。在各种非手术治疗无效时,手术就成为重要手段。心理治疗：受病情影响，严重影响病情治疗，所以心理治疗很重要。
脑炎后遗症一般不会自愈，一定要掌握一些治疗的方法，要针对不同的后遗症表现，采取相应的治疗，综合治疗是比较好的办法，可以在服药期间做一些有氧运动，对于治疗有好处。