脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
脑炎后遗症的治疗效果需要根据后遗症的持续时间及严重程度而定。中医可以进行康复治疗的，包括推拿、针灸治疗，效果也是不错。建议到正规的三甲综合医院看儿保医生，医生会根据小孩的情况确定治疗方案。
脑炎后遗症一般不会自愈，一定要掌握一些治疗的方法，要针对不同的后遗症表现，采取相应的治疗，综合治疗是比较好的办法，可以在服药期间做一些有氧运动，对于治疗有好处。
手术治疗：手术治疗在小儿脑炎后遗症患儿的临床治疗中占有重要的地位。在各种非手术治疗无效时,手术就成为重要手段。心理治疗：受病情影响，严重影响病情治疗，所以心理治疗很重要。
专科医院。这些个医院都是集国际、医疗、教学、科研、预防交流五位一体的三级甲等综合性医院。近几年来，医院也实现了跨越式发展，涌现了一批特色医疗项目，医院的整体规模也在不断的扩大。