各种类型的脑炎，细菌、病毒、支原体、结核分枝杆菌都可以引起脑炎，各种类型脑炎的鉴别，需要依赖儿童的发病年龄、前驱期的感染部位和症状、接触史，比如结核性脑膜炎，他就有开放性的肺结核接触史，也包括临床影像学。它的确诊还是依靠于脑脊液的检查，也就是要穿取一些脑脊液标本进行相关的检验，来达到确诊。
儿童脑炎早期会出现感冒症状、精神行为异常，婴幼儿则表现为不肯吃奶、头痛，经过的感冒治疗无效后应及时排除脑炎的，脑炎早期症状跟感冒差不多，病人会发热、全身酸痛、食欲差，随着病情发展，会出现嗜睡、兴奋、抽搐神经系统的表现。
感染脑炎初期容易与感冒混淆，但脑炎一定要早发现早治疗，否则会出现运动障碍、智力障碍等后遗症，给小孩一生造成不好的影响。小儿高热不退，伴有头痛、恶心、呕吐等症状，应该考虑脑炎，带孩子积极参与治疗。
孩子脑炎的确诊主要是做腰椎穿刺脑脊液化验和结合病史和症状分析判断。要及时给孩子降温处理，化验血象和C反应蛋白，如果是可疑脑炎的话，需要做腰椎穿刺采集脑脊液化验检查分析，判断什么性质的脑炎现象，根据血象化验和脑脊液化验结果考虑用药的问题。
小儿脑炎临床主要表现为神经精神方面的异常。神经异常的表现多有发热、头痛、呕吐、嗜睡、昏迷、惊厥等，重者则大脑、丘脑下部、底节、脑干、小脑和脊髓的症状都可能有异常表现。精神异常表现为兴奋多语、烦躁、哭笑无常、失眠、行为异常、幻觉、幻想，或表情淡漠、缄默不语、活动减少、不吃、定向力差、记忆力减退、大小便失禁等。
脑炎的患者的诊断一般来说是需要结合患者的病史、相应的体格检查和辅助检查才可以确诊。
发热、头痛、癫痫发作、肢体的活动障碍、肢体的某些癫痫，尤其是局灶性的癫痫发作、反应迟钝、认知行为异常、共济失调等症状的患者，在发病前可能有感冒、受凉的病史，通过辅助检查可以发现病灶，腰椎穿刺脑脊液检查也能发现相应的抗体阳性和生化异常。脑炎的诊断要结合自身免疫性疾病、局灶性癫痫发作、自身免疫性疾病引起的中枢神经系统的病变、血管性疾病、肢体活动障碍等疾病的鉴别诊断。
