CT检查是目前世界上诊断心脑血管疾病最为先进的仪器之一，可用于观察心肌、心腔、心包，以及大血管与冠状动脉血管形态学的改变等。临床上用于诊断较为常见的小儿先天性心脏病、房室间隔缺损，或者成人心肌病，如肥厚及扩张型心肌病、心肌缺血、心肌梗塞、心脏瓣膜疾病、心脏肿瘤、血管钙化及血栓等。
主要观察的项目是心脏大血管（左右冠状动脉），有无血管狭窄以及狭窄的程度，起源异常，发育变异等，来指导临床是否，干预治疗。另外还可以观察心肌是否肥厚，有无陈旧性梗死等。心脏ct还可以测量心腔的大小。另外对于心包积液以及心脏的肿瘤也有很重要的诊断价值。
CT对于头部，可以看脑组织的形态，脑组织内的密度变化，区分是否有缺血，是否有炎症，是否有肿瘤，是否有出血。CT对于脑部的颅骨也有诊断意义，是否有骨折，对于眼眶、鼻窦，对于颈椎、胸椎、腰椎，对于胸腔、腹腔、肺部，都有检查的意义。CT通过往身体里注入造影剂，对于血管，对于心脏都有诊断的意义，CT的作用是很强大的。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
心脏ct广泛应用于外伤性颅内血肿、脑损伤、肿瘤、肉芽肿、梗塞性出血、椎管内肿瘤、椎间盘突出等中枢神经系统疾病的诊断。也可以用于腹部及盆腔疾病的检查，主要是肝，胆，胰，腹膜腔，腹膜后间隙及泌尿生殖系统疾病的诊断。
CT只是一种检查机器，或说是方式，可以全身检查，也可以部分检查。CT对所有器质性疾病都可以进行检查，尤其对密度差异大的器质性占位病变都能检查出来并做出定性诊断。