脑血管疾病，通常10天为1个疗程，每日1次。急性脑血管病治疗2-3个疗程。中枢神经系统感染，每日1次，10次为1个疗程，一般不少于2个疗程。重症病人可连续3个疗程，休息7-10天继续治疗。脱髓鞘性疾病，每日1次，10次为1个疗程，一般治疗到2-4个疗程，每疗程之间休息一周。头痛，其治疗每日1-2次，疗程至症状改善为止。
临床上高压氧治疗，往往十天为一个疗程。神经损伤程度，没有中耳炎，脑脊液漏或肺气肿的情况下，有条件尽早还是高压氧，针灸，康复等综合性康复治疗。有些人不局限一个疗程，在神经功能尚未恢复的情况下，可以坚持2到3个疗程或更久。
根据患者的病情而定。除了各种类型的中毒，比如一氧化碳中毒、溺水、电击伤等引起的脑缺血昏迷的治疗。昏迷程度较深的患者，需要2-3个疗程，严重昏迷的患者，就是3个疗程以上的高压氧治疗。
高压氧费用一次2000元左右，一个疗程为10次。高压氧对于脑外伤病人的康复，有一定的辅助治疗作用，不过也看具体情况部分有效部分无效；它只是一种辅助治疗措施，它替代不了正规治疗。如果确实存在脑外伤后遗征，如头晕、耳鸣、偏头痛等症状，在病情稳定后，并且在正规治疗的情况下，是可以试一下的。
高压氧疗程一般根据疾病不同，疗程也有所差异。煤气中毒，高压氧一般一个疗程就可以了，会改善症状。但长期做高压氧有可能导致氧中毒，所以，一般按疗程治疗，中间休息3-5天。