两者差别不大，作用机理都是相同的，只是进口的提纯更好一些。乙肝疫苗要根据化验结果，打国产疫苗比较容易产生表面抗体，而且抗体滴度较高就不必要打进口疫苗，进口疫苗与国产疫苗相比价格比较贵，国家计划免疫疫苗都是国产的，适合国内消费者。但是有些个别人打国产疫苗后不容易产生抗体可以考虑打进口疫苗。
国产乙肝疫苗与进口乙肝疫苗当然不同。
国产乙肝疫苗从我国乙肝病毒携带者的血清提取乙肝病毒，再次分离出的乙肝表面抗原是经加工而成，在有效性上更适用于国人。进口疫苗比国产疫苗贵，不过进口疫苗纯度较高。
乙肝表面抗体一般只需注射一次即可产生，而国产疫苗半年内需注射三次才能产生乙肝表面抗体。
因为两种疫苗不同，所以可以根据自身情况，选择合适的疫苗注射。
国产的乙肝疫苗和进口的乙肝疫苗，由于培养的工艺还有采用的病毒株不一样，会造成产生抗体数量，免疫时间等的差异。国产的乙肝疫苗可以维持3到5年左右的保护作用，进口的理论上可以10到15年。不过也这也只是理论，现在国产的已经可以满足普通人的要求了。
乙肝疫苗是减毒灭活疫苗，不会危害身体健康，会与人体免疫系统反应，继而产生抗体，对于进口和国产的区别，第一是价钱的高低，进口的要比国产的贵不少，第二对于质量问题上，进口的相对比国产质量可能更精纯一些。但是一般使用国产疫苗就好，如果是个人喜好，或者是抗体产生不佳的情况，可以选择进口的疫苗进行注射。
国产乙肝疫苗与进口乙肝疫苗在其作用机制方面是相同的，效果没有多大差别。进口乙肝疫苗的提纯度要高于国产乙肝疫苗的提纯度。国产乙肝疫苗的免疫保护时间一般是5年，进口乙肝疫苗可维持15年以上的免疫期。
一般乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50-70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体。如果检测结果HBsAb呈阳性，且抗体滴度达10个国际单位/ML以上。