除了谷草、谷丙升高外其他肝功能指标如血清胆红素、碱性磷酸酶均可升高；但重要的是诊断免疫性肝炎主要金标准还是自身抗体检测如抗线粒体、抗体抗核抗体、抗平滑肌抗体等。自身免疫性肝炎实验室检查以y（伽马）-球蛋白升高最为显著一般为正常值的2倍以上肝功能检测胆红素、谷草、谷丙、碱性磷酸酶均可升高另外血清白蛋白、胆固醇降低反映了自身免疫性肝炎以肝细胞损害为主的特征。
自身免疫性肝炎会出现转氨酶明显上升，血清胆红素明显升高。血清白蛋白在正常下界，一般不会很低，球蛋白极度上升，白球倒置。ALP、GGT轻度升高。多种自身抗体阳性是本病的特征。
自身免疫性肝炎的化验检查，包括以下检查：
1、行肝功能的检查：发病的初期患者谷丙转氨酶和谷草转氨酶可以轻到中度的升高，异常升高的时候，常常提示急性肝炎或者其它的疾病，碱性磷酸酶迅速增高，表明可重叠原发性、胆汁性肝硬化或并发肝癌。
2、免疫学方面指标：病人可有各种自身抗体阳性表现，主要有抗核抗体、抗平滑肌抗体、抗中性粒细胞胞质抗体等。
3、组织学变化：典型组织学变化为肝汇管区有大量淋巴细胞及浆细胞浸润、侵犯周围肝实质而形成界面性肝炎，中、晚期可见到肝纤维化和肝硬化。
临床上，自身免疫性肝炎是机体对肝细胞产生自身抗体，以及自身反应性t细胞引起的肝脏炎症性病变，自身免疫性肝炎的致病因素主要包括以下两个方面：
1.自身免疫性肝炎，其遗传易感性和人类淋巴细胞抗原有关的等位基因有一定关系。
2.分子模拟假说是病毒药物和其他各种外源性物质具有与自身抗原相同或者类似的表位从而打破自身抗原耐受所致，自身反应性t细胞、和抗原提呈细胞为自身免疫性肝炎致病的又一必备条件。
自身免疫性肝炎的临床表现通常有乏力、纳差、黄疸等。
自身免疫性肝炎是由自身反应性t细胞引起的疾病，指人体对肝细胞产生了自身抗体。自身免疫性肝炎在女性多见，男女比例为1比3.6，发病年龄在30-40岁之间。部分患者可能无明显症状，但也有患者表现为乏力、腹胀纳差、黄疸等，还可能出现肝大、压痛、脾大、蜘蛛痣等情况，后期可能会发展成肝硬化。在确诊后，患者应积极配合治疗，定期复诊，可以遵医嘱使用保肝、护肝的药物，以免肝功能严重受损。
病毒性肝炎和自身免疫性肝炎，需要通过一系列的检查才能达到确诊，而检查的主要项目由实验室检查包括，血清球蛋白，病毒性肝炎标志物，循环中自身抗体高滴度，血清碱性磷酸酶等，而且还需要通过B超的检查等来确定到底是否是自身免疫性肝炎。