治疗用以下方法比较好：局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。静脉治疗：快速静脉滴入低分子右旋糖酐（儿童10~15ml/kg，成人500ml）及葡萄糖盐水，待休克好转则继续静脉输液维持。
治疗可以用：局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。抗生素治疗：在决定应用抗生素时，应考虑到疾病的严重程度，病人的年龄，卫生状况，进一步传播的可能性和造成细菌耐抗生素的可能性。此外，早期用适当的可吸收的抗菌药物治疗，可明显减轻症状和减少志贺菌的排出。
治疗的方法说是病原治疗的方法，通常需联用两种不同类型的抗菌药物，足剂量、长疗程。对于肠道黏膜病变经久不愈者，可采用保留灌肠疗法。还有一般治疗的方法，卧床休息、消化道隔离，隔离至临床症状消失，大便培养连续两次阴性。给予流质或半流质饮食，忌食生冷、油腻和刺激性食物。
应采用中医治疗，按中医分型辨证施治用汤药治疗，同时可加用针刺治疗以调整肠道功能紊乱。抗菌治疗，在治疗上一定要保持水电解质酸碱的平衡，对脱水者来说，一般应该口服补液严重者需要输液来进行均衡身体。
细菌性痢疾是由于细菌导致的，所以应该选择敏感性的抗生素来治疗。可以经验性使用药物，同时进行药敏实验，及时调整药物治疗。同时应注意避免服用止泻的药物以免加重病情。可是适当给予盐水来改善失水的情况，保持水电解质的平衡。
治疗的方法有寻找诱因，对症处置的治疗方法，避免过度劳累，勿使腹部受凉，勿食生冷饮食。还有局部灌肠疗法：使较高浓度的药物直接作用于病变部位，以增强杀菌作用，并且刺激肉芽组织新生，一般作保留灌肠。