免疫性肝炎临床上没有具体明确的病因，主要认为和人体机体自身免疫功能紊乱有关，和遗传因素易感性关系很密切。在遗传易感性的基础上，出现自身免疫耐受功能的失衡，导致机体产生对自身肝细胞的抗原抗体反应，进而引起相关的损害，也可以导致肝纤维化，甚至肝硬化。
临床上，自身免疫性肝炎是机体对肝细胞产生自身抗体，以及自身反应性t细胞引起的肝脏炎症性病变，自身免疫性肝炎的致病因素主要包括以下两个方面：
1.自身免疫性肝炎，其遗传易感性和人类淋巴细胞抗原有关的等位基因有一定关系。
2.分子模拟假说是病毒药物和其他各种外源性物质具有与自身抗原相同或者类似的表位从而打破自身抗原耐受所致，自身反应性t细胞、和抗原提呈细胞为自身免疫性肝炎致病的又一必备条件。
轻度脂肪肝多无临床症状。仅有疲乏感，而多数脂肪肝病人较胖。脂肪肝病人多于体检时偶然发现。中、重度脂肪肝有类似慢性肝炎的表现，可有食欲不振、疲倦乏力、恶心、呕吐、肝区或右上腹隐痛等。肝脏轻度肿大可有触痛，质地稍韧、边缘钝、表面光滑，少数病人可有脾肿大和肝掌。当肝内脂肪沉积过多时，可使肝被膜膨胀、肝韧带牵拉，而引起右上腹剧烈疼痛或压痛、发热、白细胞计数增多，误诊为急腹症而作剖腹手术。
免疫性肝炎主要有：ⅰ型(经典自身免疫性肝炎)以女性多见，有抗核抗体及抗平滑肌抗体(抗肌动蛋白)。ⅱ型则以儿童多见，以存在抗肝、肾微粒体1型抗原的抗体为特征。ⅲ型以存在抗肝脏可溶性抗原的抗体为特征。自身免疫性肝炎，以女性病人多见，女男之比为4：1，此外，青少年期是发病高峰期，女性绝经期为另一小高峰。
自身免疫性肝炎是一组原因不明、伴有血清自身抗体、高球蛋白血症和肝脏慢性炎症及纤维化组织学改变的反应性肝病。迄今为止，该病的病因和发病机制尚未完全阐明，其致病过程可能涉及到遗传、病毒感染、免疫异常等多因素参与。
自身免疫性肝炎是由于自身免疫所引起的一组慢性肝炎综合征，由于其表现与病毒性肝炎极为相似，常与病毒性肝炎混淆，但两种肝病的治疗迥然不同。身免疫性肝炎为遗传倾向疾病，具备易患基因的人群可在环境、药物、感染等因素激发下起病。