小三阳可以通过抗病毒治疗，最大限度的长期抑制病毒复制，对部分适合患者尽可能追求临床治愈，也就是转阴。应用干扰素a，干扰素主要通过诱导宿主产生细胞因子起作用，在多个环节抑制病毒复制，达到抗病毒作用。
乙肝小三阳的转阴主要指的是乙肝病毒定量的转阴。乙肝小三阳病情的进展，发生肝硬化、肝癌的危险因素，主要来自于乙肝病毒的复制。所以乙肝小三阳的转阴，首先应该将病毒定量转为阴性，可以选择口服药物，可以在短期内将病毒转阴，肝功能恢复到正常。
对于乙型肝炎和小三阳性疾病的病人，可以通过治疗达到治疗好的效果。临床治疗主要包括两个方面：一是肝功能处于正常状态；二是在目前的检测水平下，无法在病人血液中检测到乙型肝炎病毒，甚至可以从其表面抗原中产生表面抗体，这是一种相对理想的状态。饮食上应该注意清淡。
小三阳是不容易转阴的，不是打几针就能使其转阴的。无论是“大三阳”还是“小三阳”，如果肝功能正常，又没有明显的现象，都称为乙肝这种肝病病毒携带者，这种不用治疗，半年或一年查一下肝功、B超。平时注意饮食少饮酒、保持良好心态。平时一定要注意不要过于劳累，禁酒，不要吃肝损害的药物。多喝水多吃蔬菜水果。
小三阳转阴是不容易转阴的，经过治疗可以做到HBV-DNA定量水平下降到1000copies/ml以下，目前可以定期监测肝功能，如果正常无需治疗，密切接触家人要注射乙肝疫苗预防感染。平时多注意休息。
如果已经转阴就要及时的注射乙肝疫苗，注意合理科学饮食：饮食宜清淡，绿色蔬菜和水果，宜多吃。少吃辛辣刺激等食物。适当锻炼，避免疲劳。注意休息，不要熬夜。避免过度劳累，预防感冒，提高个人免疫力。