手足口疾病的主要传染源为病人本人和隐性的感染者。在流行期间，病人为主要的传染源，因手足口病为肠道病毒，它主要经粪口传播、呼吸道飞沫传播，也可经病人皮肤、黏膜上的疱疹液而传染。
手足口病是肠道病毒感染引起的传染病，人是肠道病毒的唯一宿主，人对肠道病毒普遍易感。患者、隐性感染者和无症状的带毒者都是本病的传染源，通过密切接触进行传播。病人口咽部的分泌物，可以通过呼吸道飞沫传给其他人。
有20多种肠道病毒导致手足口病，其中最常见的是CoxAsckievirusA16（CoxA16）和肠道病毒71（EV71）。手足口病的感染源是患者和潜伏感染。在流行期间，患者是主要的感染源。患者在疾病发作后1至2周将病毒从咽部排出，并且病毒在约3至5周内从粪便中排出。疱疹液体含有大量病毒，病毒在破裂时会溢出。药物携带者和散发病例是间歇性和流行期间的主要感染源。
手足口病传播方式多样，以通过人群密切接触传播为主，病毒可通过唾液，疱疹液，粪便，污染的手，毛巾，手绢，以及床上用品、内衣等引起间接接触传播，传播途径有密切的接触引起。
手足口病是由肠道病毒感染引起的一种传染性的疾病，好发于三岁以下的婴幼儿，主要通过消化道、呼吸道和密切接触等途径传播。根据病情轻重的不同，有普通病例和重症病例。