小儿手足口病的防治方法是：儿童出门后要勤洗手，不能喝生冷的水。宝宝的奶瓶、奶嘴等可以直接进入的东西要及时清理，在手足口病流行期间，不能让孩子去人群多的地方，特别是在公园等公共场所。
家庭要做好室内的清洁和消毒，定期通风、晾晒儿童的相关用品。避免接触儿童患有手足口病。在家里要注意孩子的精神状态，手、脚、口、臀等部位有没有皮疹或者疱疹，一天三次，多喝水，有手足口病的典型表现，要及时就医。
板蓝根是否能预防手足口病尚未得到确认。
板蓝根的功效是清热解毒，凉血消肿，利咽。对流感、SARS等呼吸道病毒具有很好的抑菌效果，如果在流感、非典型肺炎等呼吸道传染病的发生初期，及时服用少量的板蓝根，可以有效地防止流感、SarS等多种疾病。但是不要让宝宝长时间吃板蓝根，以免损伤宝宝的肠胃，引起肠胃方面的问题，如腹痛、腹泻等。手足口病是由于肠内的病毒所致，但尚无证据证明它能有效地控制肠内的病毒。
手足口病在夏天和初秋很容易发作，所以这段时间不要让孩子去人群密集的地方。其次，如果周围有手足口病患儿，应尽可能避免与接触。同时，不要让孩子触摸不干净的东西或咬们的手。目前，防疫站也有一种预防手足口病病毒的疫苗。
一般情况下，手足口病预防针可以认为长久免疫，具体内容如下：
手足口病主要是由于肠道病毒感染所致，而肠病毒71是导致手足口病的主要原因。肠道病毒71型灭活疫苗是一种手足口病的预防接种。由于肠道病毒71型灭活疫苗不能进行交叉接种，因此接种了手足口病也不能防止其他肠道病毒感染导致的手足口病。手足口病疫苗是一项长期的预防措施，因为大部分人在5岁以上就能得到天然的免疫力，所以可以说是长期的。
手足口病它有一定的自愈性，不是很危险。有发热、口疼、手足起疹症状，只需要在家隔离就可以了，用药也只能缓解不适，通常一周左右疱疹会自行消退，体温也降至正常，没有任何后遗症状。极少数危重型病例会出现心、肺、脑并发症则预后凶险。这类病情变化多发生于起病2至5天之内，会有精神状态不好，心跳加快，呼吸急促，头疼，呕吐等症状。