乙肝小三阳患者病情恶化程度不同，治疗方法也不同，首先对于肝功能异常的患者，建议保肝治疗；对于免疫功能低下的患者，建议免疫调节治疗；也可以采用抗病毒治疗，比如恩替卡韦。
可能是乙肝病毒携带的状态，可以进一步检查乙肝DNA和肝功能的情况，如果两项指标都没有明显升高，可以考虑定期复查。如果一个人DNA和肝功能都有明显的升高，是需要进一步抗病毒治疗的。
乙肝病毒病人有大三阳小三阳，以及单纯表面抗原阳性等多种存在形式，需要结合肝功症状，病毒数量多少，确定是否用药治疗小三阳病人，如果肝功正常，病毒数量不多，是不需要用药治疗的，定期复查就可以，平时不要饮酒，不使用对肝脏有损害的药物。
小三阳是乙肝当中的一种类型，包括的指标比较多，主要有以下几方面，已感染乙肝病毒的标志乙肝表面抗原：是乙肝病毒的外壳蛋白，本身不具有传染性，但它的出现常伴随乙肝病毒的存在。中和性抗体标志，是否康复或是否有抵抗力的主要标志是乙肝表面抗体，若只有它为阳性，应视为乙肝疫苗接种后正常现象。乙肝病毒复制停止标志的是乙肝e抗体，病毒复制减少，传染性较弱，但并非完全没有传染性;。
小三阳是指患者或者乙肝病毒携带者体内乙型肝炎病毒的免疫学指标，小三阳提示患者有乙肝的感染或者乙肝病毒复制较慢，小三阳的病人有可能会有乙肝的发作。乙肝小三阳是乙肝五项的第一项、第四项和第五项阳性，也就是表面抗原阳性、抗体阳性、核心抗体阳性。
乙肝小三阳转氨酶升高是需要加强一些保肝降酶的治疗并同时要检查乙肝DNA，腹部彩超，甲胎蛋白，血常规等指标，如果病毒量高，腹部彩超提示有肝硬化，就需要进行规范的抗乙肝病毒等综合治疗，如果病毒量低，或者病毒是阴性的，暂时不需要抗病毒治疗，加强一些保肝降酶的治疗就可以，需要充分的休息，绝对不能喝酒，一定要做到定期的复查。