有出生后不久出现昏睡、呼吸困难和惊厥等，并于数天或数周内死亡。其他症状有意识运动障碍、智力迟钝、肝脾肿大、耳聋和中枢神经系统症状等。只有少数在出生后3个月发生间歇性发热、肺炎和单核细胞增多症。
成人感染巨细胞病毒，多数为隐性感染，临床上无症状、体征出现，或出现单核细胞增多症的表现发热，体温波动于38.5-40度不等，可持续数日到数周。淋巴结肿大，以颈部淋巴结最为常见，腋下、腹股沟淋巴结也常累及，淋巴结呈中度硬度，分散而不粘连。
有出生后不久出现昏睡、呼吸困难和惊厥等，并于数天或数周内死亡。其他症状有意识运动障碍、智力迟钝、肝脾肿大、耳聋和中枢神经系统症状等。只有少数在出生后3个月发生间歇性发热、肺炎和单核细胞增多症。
新生儿巨细胞病毒感染的症状主要有：
一、先天性感染。感染后的胎儿除了流产、死产外，约有5%的活婴，有典型的多系统多器官脏器受累。
二、围生期感染。主要是分娩时经过产道感染、经宫颈逆行感染、产后哺乳感染等。出生时没感染症状黄疸，主要有紫癜、早产、脑积水、肝脾肿大、小头畸形、体重过轻、脉络膜视网膜炎、脑积水、脑组织钙化、低钙惊厥、小儿畸形、皮肤瘀斑、脑组织钙化等情况。
巨细胞病毒感染，不同的人体器官，症状也不相同。如果出现呼吸道感染则以发热，咳痰咳嗽为主，严重者可出现明显喘憋，甚至呼吸衰竭，胸部影像学检查，可以看到大面积片状阴影，容易继发细菌感染。如果巨细胞病毒感染，消化道可以出现腹痛腹泻，恶心呕吐等症状，也有部分会出现肝功能异常，厌食等症状。
新生儿巨细胞病毒感染有宫内感染、围产期的感染两种。
1、宫内感染，即母亲在子宫中感染了巨细胞病毒，这种胎儿有可能会流产，也有可能是死胎。新生儿也有可能会出现神经功能方面的问题，或者是神经系统受到了伤害。
2、围产期的感染，这是由于围产期的宫颈、产道的逆行感染所致，有些孩子不会表现出明显的临床表现，有的孩子会出现呼吸系统和肝脏的损伤。