普通酒精消毒对于手足口病的病毒是不起作用，但是含氯消毒液对这种病毒有很好的杀菌效果，并且该类病毒在超过60摄氏度的热水中是不可以存活的，所以要选择适合的消毒方式。宝宝经常使用的东西或所处环境可以用84消毒液或者漂白粉按要求稀释后进行消毒，孩子的一些餐具、牙具和奶瓶等可以用煮沸的办法消毒，进行高温灭菌。孩子的被褥可以放到室外暴晒，宝宝的房间要经常通风，一天至少两次。
孩子的餐具、奶瓶等，使用煮沸的方式或者使用高温消毒柜进行消毒就行了，孩子的衣服、被褥单独清洗，使用70摄氏度热水浸泡30分钟，之后清洗。室内注意通风，每日通风2-3次，每次不少于30分钟，通风时，孩子可以去别的房间，避免着凉。
手足口日常消毒可以使消毒液消毒。孩子的碗、筷子、玩具需要用热水煮沸起到消毒的作用。手足口患者接触的床上用品，衣物应该彻底清洗以后放到阳光下暴晒，如果家里有紫外线灯，也可以使用紫外线灯照射一小时。
手足口病毒不耐热，对紫外线和干燥都比较敏感。病毒在50度时，被迅速的灭活，而在零下20度可以长期存活。所以，家里可能被污染的东西能够加热煮沸消毒的物品尽量煮沸消毒，不能够煮沸加热的，可以放在阳光下暴晒，紫外线消毒。
手足口病主要是由肠道病毒感染引起的，有传染性，在消毒的时候是需要避免密切接触的，防止发生交叉感染等，另外一定要配合医生，还要注意保持出疱疹部位的清洁，家里面要注意消毒，注意通风。
食具、饮具，首选热力消毒的方法，如选用红外线或者煮沸消毒的方法。衣服、被单煮沸20分钟，或者用消毒剂作用30分钟，不能用水洗的物品，可以放到阳光下曝晒，也有很好的效果。衣服可以在阳光下曝晒，室内需要保持通风换气。