口腔疱疹指疱疹性咽峡炎，而不是指单纯疱疹，因为单纯疱疹出现在口周、嘴唇附近，可以出现在皮肤上，并不是在口腔之内，手足口病的皮疹除了口腔之内，还可以出现在手心、脚心、肛周，皮疹的形态主要是红丘疹、疱疹。
手足口病(HFMD）是一种口腔疱疹病毒感染。也是一种病毒感染，但主要的病毒类型不同。口腔疱疹主要表现在口腔，有一些疱疹病人，主要表现为发热、咽喉疼痛等症状，手足口病病人主要表现为手脚以及口腔粘膜等部位的疱疹。日常生活中应要注意个人卫生。
一般情况下，手足口病、口腔疱疹可以采用以下方式进行治疗：
1.手足口病：患有手足口病，患者可以在医生指导下使用利巴韦林颗粒、布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂等药物进行治疗。平时做好防护工作，不要抓挠患处。
2.口腔疱疹：患有口腔疱疹，患者可以遵医嘱使用甲钴胺片、盐酸伐昔洛韦颗粒等药物进行治疗。平时注意口腔卫生。
单纯疱疹与手足口病的区别可通过感染的病毒类型、水疱分布、表现及病人症状识别。如Ⅰ型单纯疱疹由疱疹病毒感染引发，仅头面和口唇部有小水疱，水疱疱壁薄且易破裂糜烂，易复发，病人极少发热。
疱疹性咽颊炎的疱疹位置主要以口腔为主，而得了手足口病的孩子，疱疹除了出现在口腔以外还会出现在手，足，口，臀部或者膝盖部都会同时出现。手足口病和疱疹性咽颊炎都属于肠道病毒引起的呼吸道传染病。