接种甲肝疫苗后，一般不会出现发热、不适等症状。
只有极少数人会出现低热、全身不适、恶心等症状。同时，由于甲肝疫苗属于甲肝减毒活疫苗，注射部位也会出现红肿。因此，接种甲肝疫苗后，少数人会出现注射部位红肿热痛、全身不适等症状，发热为主要疫苗反应，这些症状可以自行缓解。注射完疫苗后，患者通常需要静待半个小时，防止出现不良反应。
宝宝注射甲肝疫苗不良反应可能有很多，具体分析如下：
宝宝注射甲肝疫苗可以发生不同程度的局部或者全身反应，也有少数宝宝反应比较严重，可以引起注射部位的红肿、疼痛，宝宝也可以出现发热、头痛、乏力、恶心、周身不适等全身反应。这种反应多数与疫苗所含的蛋白质抗原，或者微生物本身的毒性有关，一般不需要治疗，1-2天可恢复正常。
接种此疫苗后可能出现的不良反应有，发热，接种部位疼痛、硬结，厌食，恶心、呕吐，皮肤瘙痒等，在3天左右可以自然缓解。还有少部分接种者可以出现较为严重的不良反应，比如过敏性休克，应该尽快给予脱敏及抗休克治疗。
在注射甲肝疫苗之前，患者可以做一些关于甲肝抗体IgG和甲肝抗体的IgM的检查，如果已经感染了甲型肝炎病毒，在此期间，可以不注射甲肝疫苗以免导致病情的加重。
如果甲肝抗体IgG为阴性。甲型肝炎疫苗可以预防甲型肝炎抗体为阴性。所以在接种乙肝疫苗之前，必须先到医院做一次筛选，然后积极进行对症治疗，以免延误病情。
甲肝疫苗自费和免费的区别是，免费的疫苗一般是由国家指定的生产厂家生产的，通过一定的经济政府补贴来免费使用，而自费的疫苗往往是由一些制作精良的生产厂家进行生产，其中有一部分还是国外进口的。
甲亢通常指甲状腺功能亢进症，甲状腺功能亢进症患者通常不可以注射甲肝疫苗。
短期内碘摄入过量、甲状腺激素分泌增加等因素可能诱发甲状腺功能亢进症，进而出现乏力、怕热、多汗等症状，还可能伴有眼睛突出、视力减退等情况。甲肝疫苗通常用来预防甲型病毒性肝炎的疫苗，包括减毒和灭活两种疫苗。注射甲肝疫苗通常不能起到预防、治疗甲状腺功能亢进症的作用。