早上口苦口臭通常是口腔卫生不佳，牙周病等因素造成的。
如果早上有口苦、口臭的症状，通常是口腔卫生不良，或患有牙周病，干口症等疾病，或有吸烟习惯，或食用某种食品造成的。如果口臭症状还在继续，患者可以去口腔科就诊。需要注意的是，有些药物如高血压、精神科用药等也会引起口臭。患者平时也要注意少吃辛辣刺激、肥甘厚味之品，戒烟限酒，适当多喝水等。
口中有明显的苦味，并伴有口干舌燥，两胁胀痛，小便短黄等症状，多见于中医辨证为肝胆湿热。临床上，急性肝炎、急性胆囊炎、急性尿道炎等肝胆湿热型的常常觉得口苦，服用医师指的药物等清热利湿、疏肝泄胆的中药，口苦的症状很快就获得改善。
早上口苦伴有口臭，多见于胃炎和反流性食道炎。机体在感染幽门螺旋杆菌以后，容易诱发胃炎和食道反流，就会出现口臭，反流物中因为有胆汁成分，会诱发口苦。另外也有可能是胆囊炎合并有牙龈出血，胆囊炎容易有口苦，牙结石或者龋齿引起的牙龈出血，因为血液在口腔科内分解，可以产生口臭症状。
大部分人早上起来都会有口臭，因为人的口腔中都有细菌，其中的厌氧菌在缺少氧气的环境中繁殖的特别快，在睡眠中因为不咀嚼，闭着嘴巴，有利于厌氧菌生长，厌氧菌在分解食物时就会发出难闻的味道，刷牙、漱口之后一般就会消除。如果伴有口苦，说明脾胃不健康、胃火旺，应该及时调理脾胃。
能够导致口苦和口臭的原因有很多，肝胆疾病可以导致口苦，口腔卫生和胃部的幽门螺旋杆菌感染可以导致口臭。肝胆疾病可以导致胆汁反流或者出现胆管堵塞，就可以导致口苦的临床现象。如果做不好口腔卫生很容易会导致口臭发生，细菌在口腔里面滋生就会导致口臭。