含氟牙膏中的氟化物能加速补充牙齿表面流失的矿物质，令初期蛀牙得以修复。还能巩固牙齿，帮助清除牙菌斑同时形成保护层，加强牙齿的抗酸能力。但如果长期摄入高剂量的氟化物，可能导致癌症、神经疾病以及内分泌系统功能失常。使用含氟牙膏的量一定要小，一般每次不超过1克，由于儿童使用牙刷还不熟练，有可能误食含氟牙膏，危害身体健康，因此儿童不要使用含氟牙膏。
含氟牙膏并不能起到去除龋齿的作用。
含氟牙膏具有防龋的作用，所以含氟牙膏可以起到防龋的作用，但是并不能治疗龋齿。当然刷牙是要刷牙的，如果使用含氟牙膏，但是刷牙效果并不是很好，所以需要刷牙，如果龋齿已经出现了，用牙膏是无法去除龋齿的，需要去口腔科治疗，由医生进行龋齿补牙，这样才能去除龋坏组织。平时还需做好口腔护理，减少病菌滋生。
有蛀牙可以用含氟牙膏，这个可以有效的预防蛀牙。但是牙膏主要起的是磨擦剂的作用。
有龋齿发生，治龋齿以充填为主，即将龋坏的组织清除干净，做成某种洞形后进行洗涤和消毒，使用充填材料和培养良好饮食习惯至关重要，含氟牙膏只是辅助手段。对于糕点，糖果，蜜饯和饮料少吃，饮食保持含糖低，致龋力低，含纤维较多，抗龋性较强；要按时吃饭、吃完东西漱口、刷牙。平时用巴氏刷牙法，每天刷2-3次
儿童可以使用含氟的牙膏进行刷牙，可以防止龋齿的产生。
三周岁以下的孩子用氟化物的牙膏，一次用一颗米粒那么大的牙膏；三周岁以上的儿童使用氟化物的牙膏，可以在每次使用黄豆或豌豆大小的牙膏来刷牙。对于年纪较大的孩子来说，使用含氟牙膏是没有问题的，因为孩子的吞咽反应很好，不会发生误吞。但如果孩子较小，可能会出现误吞的情况。
含氟可以和牙齿中的钙发生化学反应，在牙齿表面形成一层氟化钙，可抵御酸性物质的侵蚀，有效防止蛀牙。儿童不宜使用含氟牙膏。因为儿童抵抗力较低，长期或大量使用含氟牙膏，容易造成“氟中毒”。