要想去除牙齿上的黑色污垢，还是到正规医院的口腔科、大型医院的牙周病科进行牙周治疗，用超声洁治器去除牙齿表面的色素沉着。另外回家以后饭后要好好刷牙，还要用正规品牌牙膏。
临床上主要是采用超声波洁牙器，来去除牙齿表面的色素沉积或者采用洗牙来去除牙齿上的黑线。建议如果牙齿上有黑线应该到医院就诊，来确定牙齿上黑线的原因，然后针对不同的情况进行不同的治疗。
儿童牙齿黑色污垢，首先要辨别是否有牙齿表面的缺陷。如果有黑色污垢，同时还会出现小斑块状的缺损，就是龋齿的形成。牙齿表面出现黑色污垢，可能是因为牙齿表面不平整，或者儿童刷牙的时候没有刷牙，或者是口腔中含有产黑色素的杆菌，所以才会出现这种情况。如果没有影响外观，也不会有太大的影响。如果必须要去掉，儿童要去口腔医院做牙齿的磨砂，把色素带去掉，同时还要保持口腔的清洁，保持牙齿的平滑，这样可以减少黑色污垢。
到正规医院口腔科或者是牙周科进行牙周治疗。需要自己进行好好的刷牙。虽然医院进行了洁治或者是刮治，但是长期的保护任务还在患者自己。可以采用中华口腔医学会推荐的巴氏刷牙法，每天至少刷早饭后加睡前刷牙共2次，每次不少于3分钟。需要忌烟，去除了病因才能彻底的去除烟渍。
牙齿黑色污垢的去除方法，根据污垢的性质而定，如果牙齿的黑色污垢，是牙齿长期处于一种深颜色的环境中导致的一种牙齿外源性着色，或者是牙齿周围有食物残渣软垢，牙菌斑等没有及时的清除，唾液钙化形成的软垢，可以通过洗牙的方式去除，如果牙齿的黑色污垢，是由于牙齿龋坏形成的，洗牙不能去掉，需要进行龋齿的充填。
可以手动器械洗牙，超声波洗牙和喷沙洗牙。手动器械洗牙就是医务人员用洁牙工具将牙齿中的软垢结石等，一点点刮掉超声波洗牙主要是通过超声波振动来清除顽固牙石，平时注意个人的口腔卫生。