可以保守治疗，取出扁桃体结石，对于顽固的扁桃体结石保守治疗效果不好，可以考虑扁桃体切除术，能够消除咽部的不适感觉以及口臭。扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，长期处于阻塞分泌物引流不畅。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
扁桃体结石不严重，但是扁桃体结石会引起病人扁桃体胀痛、口臭、反复发炎等相关症状。扁桃体结石是由于长时间的辛辣刺激食物的摄入，不注意口腔卫生，从而导致扁桃体分泌物无法排出体外，在扁桃体上隐窝口处形成结晶，从而形成嵌顿。
扁桃体结石主要是由于扁桃体隐窝引流不通畅，导致内部存留的干酪样腐败物，一般会从口腔内咳出，呈淡黄色或白色，会伴随有异味。引起这类疾病的主要原因，会和反复发作的扁桃体炎或者不注意口腔卫生，食物残留于扁桃体隐窝内导致。
扁桃体结石如果张嘴可以明显看到，可以用镊子夹出来，可以到耳鼻咽喉科门诊去取出来的，在耳鼻咽喉科门诊有专门的工具。大部分人都可以取出来的。如果取不出来或者有出血的，就不要盲目去取。就需要通过手术切除扁桃体，才能治疗扁桃体结石的。平时也需要注意保养，尽量避免吃辛辣刺激食物，注意口腔卫生，饭后注意漱口，也可以预防作用。