智齿被肉包起来，可以在麻醉注射以后将表面的肉切开，暴露出牙齿或者骨面，如果有牙槽骨在牙冠上方，需要去除表面的牙槽骨，并且进行剥离，必要时需要进行牙龈翻瓣，然后将牙齿挺出。如果是阻生齿可以用涡轮智齿手机将智齿阻生的部分磨除，然后再将剩余的部分拔除。拔除智齿以后，需要缝合止血，并且用无菌棉卷压迫止血。术后常规给予抗生素预防感染。
智齿一半被肉包着不好拔，因为如果智齿是其他方向的阻生，需要进行一个小手术，彻底的拔除智齿。尤其是备孕期间的女性，一定要积极的拔除智齿、去除隐患，以免在怀孕期间引起智齿冠周炎。而且智齿水平阻生有很多的危害，容易导致牙龈的发炎和前牙的龋齿。
考虑是长智齿出现了智齿冠周炎的症状，建议到正规医院的口腔科做冠周冲洗。利于炎症的消除，如果平时智齿反复发炎，并影响相邻的牙齿。建议等智齿炎症消除后拔除智齿。
智齿长出一半被肉包着，首先要拍摄一张曲面断层的X光片。通过X光片判断智齿萌出的方向以及部位。如果智齿是垂直方向的阻生，需进行牙槽骨修整术和牙龈切除术，将智齿牙冠完全暴露在口腔内。
长了两年多的智齿一直被肉包着长不出来可以去医院进行拔除，拔牙后2个小时内不能吃东西，24小时内不能刷患处，平时要注意口腔卫生，每天睡觉前要刷牙。平时还需保持口腔的清洁卫生，做到早晚刷牙，饭后漱口，定期洁牙，出现龋齿等引起的不适，一定要尽早及时的做治疗。
智齿被牙肉包着长不出来还很疼就应该需要先消除炎症可以口服抗炎药物，局部冲洗肿胀牙龈，然后去医院口腔科拍个全景片，判断智齿的位置，如果位置不正就要及时拔除。它应该是智齿局部发炎引起的智齿冠周炎的症状。