嘴巴起泡可以选择外用药或者是口服药物治疗。首先应当区分嘴巴起泡的具体位置，如果是在唇周起泡，疱疹透明、泡液清亮透明，多为病毒感染所致的，建议给予阿昔洛韦软膏外涂即可。如果疱疹位于唇周，但是泡液颜色发黄，且抓破后脓液流过的地方新发疱疹，建议给予抗生素治疗。
口腔疱疹包括口腔单纯性疱疹、口腔带状疱疹、手足口病。口腔单纯性疱疹是由单纯性疱疹病毒引起，原发性疱疹性口炎多见于儿童，口腔带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒引起的急性感染性疾病。手足口病是由肠道病毒引起的传染病。无论何种病毒引起的疱疹病毒感染，治疗都是差不多的。
舌头上经常起泡通常可以通过日常护理、使用药物等方法处理。
如果患者舌头上经常起泡，考虑是口腔溃疡，口腔溃疡是一种在口腔粘膜上形成的浅性溃疡，大小从米粒到黄豆大小，呈圆形或椭圆形，溃疡面呈凹状，周围充血，吃了刺激性的食物会引起疼痛，一到两周就会自行愈合。口腔溃疡是一种周期性的、反复的疾病。期间患者要清淡饮食，若口腔溃疡反复发作，还需口服药物，补充维生素和微量元素，有的还需使用免疫增强剂或免疫抑制剂，通过全身及局部用药治疗。
水泡比较小的话，可以自行康复，不必处理。如果水泡大的话，用消毒针挑破水泡，里面的大部分液体会流出，此时用消毒棉签蘸上碘伏涂抹水泡，每天进行处理，3到5天即可痊愈；还可以在挑破水泡后，用20克食盐溶入180毫升凉开水中，以纱布浸透敷于患处，另备一盆凉开水作为清洗之用。如果所起的水泡比较大，皮肤创面也比较大，为了避免被病菌感染，最好到医院治疗。
嘴里起泡是创伤性血泡。由于进食了过烫过硬的食物或者是大嚼快咽，食物强力的摩擦口腔粘膜，形成了创伤性的血泡。在排除血液性疾病的前提下，可以用无菌注射器把泡血抽出来，用无菌组织剪把泡壁剪去，二是疱疹性口腔炎的水泡期。
