扁桃体并没有结石存在，慢性扁桃体炎以及扁桃体角化症都可以出现扁桃体表面有乳白色颗粒状或点状物，慢性扁桃体炎表面的乳白色分泌物是由扁桃体腺窝内大量的脱落上皮细胞、淋巴细胞、白细胞及细菌聚集而形成。
扁桃体结石如果不加以治疗只会越长越大，不可能会在不做治疗的情况下自行愈合，所以如果患上扁桃体结石一定要积极配合医生治疗，扁桃体结石不是特别难以治疗的疾病，但是如果长期不治疗，也会使结石越长越大，在此提醒各位扁桃体结石患者，扁桃体结石的发病初期是治疗的时间。
扁桃体结石是不会癌变，是上皮过度角化的疾病。扁桃体结石是扁桃体的一个慢性疾病，同时可伴有其他咽喉部黏膜的结石。扁桃体结石，主要是由于扁桃体的急、慢性炎症，导致扁桃体隐窝处的上皮过度角化，局部所形成的一种尖锐的沙粒状物，附着在扁桃体表面。
扁桃体结石是可以自己抠掉的，扁桃体结石，是由扁桃体的脱落上皮细胞和食物的残渣混合而形成的，和扁桃体的联系也不是十分紧密，并没有血液供应，不存在出血的可能，只要自己的方法得当，完全可以通过自己的努力把他清理出去。如果自己没有清理干净，可能还会反复发生，可以到医院治疗。如果反复多次发生，无法清理，可以手术切除双侧扁桃体。
长期扁桃体结石会使病人感到不适或疼痛。结石的成分中含有大量的磺胺类物质同时携带大量细菌，当结石破碎时会散发出类似臭鸡蛋气味的硫化物气体，产生令慢性口臭。