治疗桥本甲状腺炎中医可以使用疏风解毒汤，方药组成有双花、桔梗、牛子、山豆根、连翘、菊花、桑叶、黄芩、射干、地丁、夏枯草、虎杖、公英、浙贝母、皂角刺、甘草等，加入清水后进行煎服，能起到清热解毒、疏风解表、利咽止痛的效果。
还没有相应有效的药物可以使这些抗体明显降低。所以说桥本甲状腺炎主要是定期复查甲功，只要甲功水平是正常的就不需要特殊治疗。如果甲功出现甲减的情况，需要针对甲减的情况进行补充甲状腺激素的治疗。
可以通过针灸治疗桥本甲状腺炎，本氏甲状腺炎是一种自身免疫性疾病。表现为甲状腺的自我损伤，主要是以免疫抗体升高为主。不需要做多特别的处理，但需要监测甲状腺素的情况，如果出现甲状腺素的分泌异常才需要治疗。
桥本甲状腺炎可以药物治疗，糖皮质激素治疗，本病一般不使用激素治疗对一些疼痛性慢性甲状腺炎病人甲状腺疼痛、肿大明显时，可加用药物，好转后逐渐减量，用药1～2个月。
首先可以考虑使用甲状腺激素制剂进行治疗，特别是在甲状腺功能正常或低下的时候，可以选择使用甲状腺制剂进行治疗，其治疗效果是非常好的。但在服用这种药物的时候，需要根据甲状腺功能以及甲状腺肿大程度来制定合理的计量。
桥本甲状腺炎属于自身免疫系统疾病，也就是自身免疫系统出现了一些小问题，使得体内出现了大量攻击自身甲状腺细胞的抗体，比如甲状腺过氧化物酶抗体或者甲状腺球蛋白抗体。