这个药物主要是针对临床当中软骨的退变，磨损，也可以治疗软骨的外伤，也可以治疗因为软骨的退变，磨损所引发的关节炎症。也可以治疗风湿，类风湿性的关节炎，改善骨质疏松症。
最基础的区别就是硫酸软骨素是单方药物，而氨糖软骨素是氨基葡萄糖和硫酸软骨素复合而成的复方药物。其次硫酸软骨素可以和水分子结合，滋润关节部位，主要作用是促进关节软骨再生。而氨糖软骨素中氨基葡萄糖可以保持关节软骨的代谢平衡、促进胶原蛋白的合成、修复损伤的关节软骨，氨糖软骨素主要作用就是改善关节问题。
氨糖软骨素可以用来治疗腰椎骨质增生引起的坐骨神经痛的，是治疗骨质增生间接治疗坐骨神经痛的问题的。没什么作用的，理论上来说主要是营养软骨的作用、腰椎间盘突出症保守治疗最重要及有效的办法是卧床休息。
硫酸软骨素的主要作用是降低血脂，有轻微修复软骨、促进软骨再生的作用，有一定缓解关节疼痛的作用，还能预防冠心病。而氨糖软骨素的作用是减轻关节炎症，缓解关节疼痛，抑制关节软骨破坏酶，促进软骨修复。硫酸软骨素一般都是药品，具有明确的治疗作用。而氨糖软骨素有一部分产品属于保健品，对于其产品成分的监管和控制并没有药品严格。
没有的，氨糖是运用尖端技术从海洋生物体中提取的纯天然物质，因此对人体无毒副作用。氨糖能为人体大量催生和补充关节滑液，从而不断润滑关节软骨面，减少磨损，使关节部位灵活自如。补充足量的关节滑液，也为关节软骨提供了，足够的物质载体。
氨糖软骨素是保健产品，主要作用是保护人体关节。人体关节中含有的关节软骨以及关节周围的软组织，通过服用氨糖软骨素能够起到一定的延缓关节组织结构衰老的作用，抵抗关节软骨出现的磨损状态，增加关节的润滑程度，改善关节周围软组织的炎症状态，减轻关节出现的疼痛症状。
