氢氯噻嗪是在临床上应用比较广泛的一类药品，其大多数不良反应主要与服用的疗程和剂量有关。比较常见的不良反应包括电解质的紊乱，尤其是低钾血症的出现，主要与噻嗪类药品的排钾作用有关。其次，由于氢氯噻嗪还可以抑制胰岛素的释放，干扰肾小管排泄尿酸，所以长期服用还会出现高糖血症和高尿酸血症。其他少见的不良反应包括过敏，血细胞下降，以及胆囊炎，胰腺炎，性功能减退等。
这个药物引起副作用常见的就是出现一些中枢神经系统的一些症状，出现头晕头疼乏力，还有抑郁的症状。或者上呼吸道的症状，比如可以出现咳嗽，鼻炎，鼻窦炎，还有咽炎，偶见还有一些胃肠道反应，比如出现恶心，腹痛，腹泻，还有消化不良。
首先可能会引发低血压。因为本身扩张血管的作用比较强，同时还利尿，如果循环血容量不足，就可能引发低血压。还可能会引发电解质紊乱。也可能引起胃肠道变化，出现腹胀、纳差、恶心等表现。
氢氯噻嗪片又叫双氢克尿噻，副作用和不良反应可以表现为水、电解质紊乱，出现口干、烦渴、恶心、呕吐以及极度疲乏无力。检测血的指标可以出现低钾血症、低氯血症、低钠血症等，临床表现是异位心律或者快速性的心律失常。另外还可以导致糖耐量异常而出现血糖升高、尿糖升高等，还可以干扰肾小管的排泄尿酸导致血尿酸升高，甚至诱发痛风。
这种药物长期服会影响重要脏器如心、脑、肾的功能，最终可导致这些器官的功能衰竭。比如头痛、眩晕。偶见乏力、抑郁。咳嗽、鼻炎、鼻窦炎、咽炎、上呼吸道感染、鼻出血。恶心、腹泻、消化不良、腹痛。
厄贝沙坦氢氯噻嗪片对于血容量或钠不足的患者，有时会引发症状性低血压。对于肾功能损害和肾移植患者，该药可能会发生与利尿药相关的氮质血症。对肝功能损害者，该药可引起肝性脑病，所以也要慎用。对于缺血性心血管疾病的患者，可能导致心肌梗死等。