药物球囊与支架比，支架贵一些，药物球囊和支架相比，支架更好，药物球囊是在球囊外面涂有一层药物，能够阻止血管内皮细胞的增长，防止血管的狭窄。但血管再狭窄的几率非常高。而支架又分为金属裸支架和药物涂层支架，其中裸支架的血管再狭窄率也较高，而药物涂层支架的血管再狭窄率明显的下降。
药物球囊和支架相比，支架更好。药物球囊是在球囊外面涂有一层药物，能够阻止血管内皮细胞的增长，防止血管的狭窄。但血管再狭窄的几率非常高。而支架又分为金属裸支架和药物涂层支架，其中裸支架的血管再狭窄率也较高，而药物涂层支架的血管再狭窄率明显的下降，是现阶段使用最广泛、最普及的支架。所以，综合来看，支架比球囊好。
冠状动脉球囊主要针对的病人是冠状动脉已经植入了支架，支架内又发生了再狭窄，会用药物球囊进行治疗和干预，这两者没有办法横向的比较好坏，更重要的是看病变程度的不同和病变性质的不同进行选择。
通常来说，药物球囊手术费用比较高。
与冠状动脉内支架相比，使用药物球囊的成本更高。国内的支架成本在10000元左右，但仍需要植入导丝、导丝，以国内的国内设备和技术，需要花费三万元。尽管使用药物球囊可以缩短支架置入的时间，但是花费将近50000元，较国产的支架高出20000元。但是，医疗球囊可以报销，病人只需要花1-20,000元即可完成。对于一些疾病，采用非植入技术，可以获得较好的疗效。
支架是永久放在心脏血管里支撑血管，球囊只是在手术过程中扩一下血管的作用，支架永远都存在，球囊可以扩大管腔，但血管斑块硬还会弹回来，球囊也有把支架扩开的作用。把支架送入到血管病变的位置，撑开动脉血管，从而保持管腔的畅通，改善心肌和血流减轻胸部疼痛。
