扁桃体结石并不是每个人都会出现的，多见于不注意口腔卫生的人群，扁桃体结石在于预防，要养成饭后漱口的习惯，早晚要刷牙，而且多喝水等措施都可以减少扁桃体结石的形成。因为扁桃体结石是食物残渣残留在扁桃体隐窝形成的，一般都是比较顽固的，很难去除，只能在纤维喉镜直观下进行清理。如果因为扁桃体结石导致扁桃体发炎，而且反复发作，就要考虑手术切除扁桃体。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
扁桃体结石分为保守治疗和手术治疗，对于一些较顽固的扁桃体结石不应该用保守治疗，可以考虑进行扁桃体切除手术，以消除口臭以及咽部不适。保守治疗有时不能将已有的结石完全消除，存在复发的几率，直接进行扁桃体切除手术可以使扁桃体结石治好。
扁桃体结石不严重，但是扁桃体结石会引起病人扁桃体胀痛、口臭、反复发炎等相关症状。扁桃体结石是由于长时间的辛辣刺激食物的摄入，不注意口腔卫生，从而导致扁桃体分泌物无法排出体外，在扁桃体上隐窝口处形成结晶，从而形成嵌顿。
扁桃体结石主要是由于扁桃体隐窝引流不通畅，导致内部存留的干酪样腐败物，一般会从口腔内咳出，呈淡黄色或白色，会伴随有异味。引起这类疾病的主要原因，会和反复发作的扁桃体炎或者不注意口腔卫生，食物残留于扁桃体隐窝内导致。