气管镜在呼吸系统疾病的应用非常广泛，几乎可以用于呼吸系统所有疾病的诊断。如感染性疾病肺炎、肺结核的诊断，肺部肿瘤性疾病的确诊，以及肺部免疫性疾病，如结节病等疾病的确诊。通常对于感染性疾病，临床上难以确诊的情况，可以行支气管镜检查，通过肺内感染部位的活检、灌洗以及毛刷等确定病原菌。特别是肺结核，在支气管镜下，有奶酪样坏死的表现，临床通过支气管镜容易确诊。
气管镜检查，普通的检查费用在300-400元。
如果在气管里面出现增生的异物，需要进行组织检验的时候价格会更高，一般费用不超过1000元，对于需要无痛检查时费用会更高一些。价格大致是大同小异，同时气管镜比较受罪，如再能通过其他的检查替代气管镜的情况下，可以做其他方面的检查来替代，这样能减少对人体的损伤，还可以达到省钱的目的。
气管镜检查需要八分钟到20分钟左右，气管镜检查是将比较细长的一根管子，从病人的嘴里或者鼻腔进入气管和支气管以及更远端，直接观察气管和支气管的病变，甚至可以根据病变进行相应的检查和现场治疗。
气管镜检查癌症准确，目前所有的癌症的确诊主要是通过病理细胞学检查来确诊的。如果有相应的症状，例如咳嗽，咳痰等肺部症状，可以做肺部CT。肺部CT可能高度倾向于肺部癌症，但是确诊还是依赖于病理细胞学。
气管镜检查的时间大概需要十分钟到二十分钟左右，部分医院可能需要半个小时左右。这是检测呼吸道感染疾病较为常用的一种方法，可以有效掌握气管部位是否出现炎症感染，或者是结核、肿瘤等异常病变，然后进行有针对性的治疗。另外在治疗期间还要定期去医院进行复查工作，要根据病情的发展变化及时更换治疗方案和用药，这样也能促进病情更快恢复。
