这可能是咳嗽变异性的哮喘导致的咳嗽，在凌晨3点到5点迷走神经很容易发生兴奋现象，导致支气管平滑肌发生痉挛，从而引发咳嗽的出现，是由于存在气道高反应性所致，也就是气道高反应所致的咳嗽变异性的哮喘。
宝宝每天凌晨都会咳嗽是因为变异型哮喘导致的。在凌晨3点到5点迷走神经很容易发生兴奋现象，导致支气管平滑肌发生痉挛，从而引发咳嗽的出现，是由于存在气道高反应性所致，也就是气道高反应所致的咳嗽变异性的哮喘。
考虑气道有不同程度的炎症反应。气道有炎性物质分泌物的刺激，可能气道还存在有狭窄，也可能与支气管平滑肌的收缩和痉挛有关。另外就是受到了支原体、衣原体的感染。
半夜12点到1点咳嗽厉害主要是因为在夜间神经敏感性会增强，这个时间段也是肺排毒的时间，所以咳嗽的症状会比较严重，另外也可能是因为咳嗽变异性哮喘或左心功能不全导致的，咳嗽变异性哮喘患者不仅会出现半夜咳嗽明显的症状，还会出现哮鸣音，经过支气管舒张或吸入性激素治疗以后，症状会有所缓解，如果有左心功能不全的情况，患者夜间心功能下降以后也会引发严重的咳嗽。
小儿凌晨四五点咳嗽可能因感冒鼻涕过多，平躺倒流刺激咽后壁引起，也可能是支气管炎或咽炎引起的，可以到医院查血常规、胸部X线以明确诊断，咳嗽是一种反射性的保护动作，当呼吸道内有异物或分泌物时，通过咳嗽咳痰可将其排出。
半夜由于温度下降，另外，由于人的副交感神经的兴奋，气道处于收缩状态，就会诱发出咳嗽反应。什么疾病下这种反应会加重，一般见于咳嗽变异性哮喘、感染后咳嗽。这一类咳嗽的病人，气道要比一般人要敏感，容易受到冷空气刺激，另外气道容易受到植物神经的调控而发生咳嗽。