支气管镜检查是一个有一定痛苦的检查，但是它的痛苦程度总的来说绝大多数成年人是可以耐受的。只有少数年纪比较大的人、基础疾病比较多的人，或者是不能配合的儿童、婴幼儿，可能对于他们就需要通过麻醉辅助下来完成这项检查。它主要的不适感就是镜子通过喉咙，也就是声门的时候，会有呛咳的感觉，有异物感，有轻微的窒息感觉。
支气管镜检查一般是在局部麻醉下进行的，因此并没有太大的痛苦感，只要是正规的医院都能够进行，部分患者在检查后会出现恶心呕吐，以及局部疼痛等不适症状，很快就能够消失。患者通过支气管镜检查出病情程度以后，可以在医生的指导下服用药物调理治疗，期间也要注意做好各项护理的工作，戒烟戒酒，改善不好的生活习惯，这样就能够促进病情更快更彻底治愈。
纤维支气管镜检查一般人耐受没问题的，也可以做无痛的，无痛纤支镜指的是在一种麻醉药的作用下完成整个检查过程，醒来后有咽喉部的不适。有些人反应相当小，基本没有咳嗽，很快就做完了。
比较以前的支气管镜检查它的痛苦较前是明显减轻的，以前是硬质气管镜，它是一个长长的铁管子从嘴中直接到喉气管里面，现在称之为纤维支气管镜，它的柔韧性比较好；它的粗细度比较细。
支气管镜检查具有一定的痛苦，但对于大多数成人均可耐受，主要不适症状为因支气管镜经过咽喉部声门时引起呛咳、异物感、轻微窒息感，检查过程中需要患者深呼吸、轻轻咳嗽、放松心情。
支气管镜检查不痛苦。支气管镜是一种通过鼻或口进入各段叶支气管，根据CT的指引进行诊断，局部取痰或组织做病理检查，病人会感觉到不适，但支气管镜是不能代替的，需要做病理检查。也可以用支气管镜检查粘膜或纵隔淋巴结，以达到准确的诊断，而支气管镜的损伤是短暂的，病人虽然会感到不适，但很快就会康复。局麻下支气管镜在手术前要严格控制饮食，术后要做好充分的深呼吸和放松，绝大多数病人都能忍受。近来，无痛的支气管镜技术被不断的发展，它能缓解病人的疼痛。