结核菌素试验接种部位局部无红晕和硬结，或硬结平均直径小于4mm者判定为阴性，其意义表明未感染结核菌。另外，由于结核菌感染后需4～8周免疫反应才能充分建立，在此前进行结素试验也可为阴性；还可能出现阴性结果，如患急性传染病、发热、使用免疫抑制剂等；免疫功能低下如重症结核病、慢性消耗性疾病、肿瘤、艾滋病、高龄等。
肺结核皮试主要是检查有没有感染过结核。结核菌素试验又称为PPD皮试，是肺结核的皮试。在肺结核的诊断中，一般采用皮内注射纯蛋白衍生物，取其最大直径和最小直径的平均值。阴性的病人没有任何的反应，或者硬结的平均直径小于5毫米，或者是大于5毫米的平均直径小于10毫米。阳性不能确诊肺结核，也不能完全排除肺结核。应结合患者的症状、影像学和有关的肺结核诊断。
若皮试部位出现红肿，直径等于或超过15毫米为强阳性反应，强阳性反应表明有活动性感染，应进一步检查拍胸片，抽血化验，痰培养等确诊是否有结核病。另外要注意清淡的饮食为主，忌食辛辣刺激性食物和谷类的食物，注意局部的卫生。
结核菌素实验弱阳性是指皮试后经48-72小时测量的皮肤硬结直径为5-9毫米，提示结核菌或结核分枝杆菌感染，仅表示曾感染过结核，并不一定现在患病。尤其是用5IU做的皮试，阳性结果意义不大，因为成人结核自然感染率较高，所以对婴幼儿的诊断价值要高于成人。
肺结核皮试也称PPD试验，主要就是在局部的皮肤部位进行注射，局部的皮肤会出现红肿，这是PPD试验的反应，对于PPD试验的结果主要是看注射部位硬结的大小，它分为阳性、阴性和强阳性这三种结果，如果硬结直径小于5mm，一般判定为阴性，如果硬结直径在5-20mm之间，判定为阳性，如果硬结直径大于20mm或者局部伴有水泡及淋巴管炎，判定为强阳性，不同的结果临床意义不一样，一般如果是阴性，需要去接种卡介苗。
痰检阴性，尤其是多次痰检都阴性，说明已无传染性或传染性很小。通常痰检阳性的肺结核病人，经过正规的抗结核强化期治疗后，基本都可以痰检转阴，然后再进行巩固期的治疗。