复方血栓通胶囊在服用后可能会出现胃部刺激症状，如烧心、反酸、恶心等，个别的可能会出现过敏反应，会出现局部皮肤的发红、皮疹、发痒、丘疹等，另外极个别的情况可能会出现肝功能异常，导致转氨酶升高。
复方血栓通软胶囊活血化瘀，益气养阴，强身健体促进血液细胞新陈代谢，平衡调节血液细胞双向调节中枢神经，提高脑力，增强学习和记忆能力增强机体免疫功能，抗肿瘤止血、活血化瘀。
复方血栓通胶囊主要成分就是丹参，三七，黄芪这样的成分，成分比较明确，副作用就比较少，很少引起不良反应，所以可以长期的服用比较安全，但是也是需要定期的复查血常规，肝肾功。可以长期服用，定期检查就可以了，平时要注意生活规律，注意卫生。
可以长期服用，复方血栓通胶囊活血化瘀，用于血瘀所导致的视网膜静脉阻塞，症见视力下降或视觉异常，眼底瘀血征象以及稳定性劳累型。复方血栓通胶囊是中成药，为理血剂，具有活血化瘀，益气养阴之作用。
功能主治有活血化瘀、益气养阴，用于治疗血瘀兼气阴两虚证的视网膜静脉阻塞，症见视力下降或视觉异常、眼底淤血征象、神疲乏力、咽干、口干等，以及用于血瘀兼气阴两虚的稳定性劳累型心绞痛，症见胸闷痛、心悸、心慌、气短、乏力、心烦、口干者。
血栓通胶囊的化学成分是三七总皂苷，是临床常用的活血化瘀的药物，常常用于冠心病、脑梗死、脑栓塞、中风后遗症的治疗，血栓通的作用主要是扩张血管、止血祛瘀、改善血液循环及微循环等作用，副作用比较小，偶见干呕、头晕症状，一般停药后可恢复，引起效果较好，副作用较小。