阿莫西林属于青霉素类药，所以如果有对青霉素过敏及青霉素皮肤试验阳性患者禁用。其次，还有个胃肠道反应，有人会恶心呕吐。药物经过肝脏解毒和肾脏的排泄所以肝肾功能不太好的人用量都要酌减。
阿莫西林的副作用不大。阿莫西林可出现的副作用有恶心、呕吐、腹泻及假膜性肠炎等胃肠道反应。皮疹、药物热和哮喘等过敏反应。贫血、血小板减少、嗜酸性粒细胞增多等。血清氨基转移酶可以轻度增高。
阿莫西林胶囊可出现胃肠道的反应，包括恶心、呕吐、腹泻、腹痛及假膜性肠炎等；过敏反应，包括皮疹、发热、支气管哮喘急性发作等；贫血、血小板减少、嗜酸性粒细胞增多；肝功能不全，血清氨基转移酶可轻度升高。
一般来说消炎药都是有副作用的，建议根据自身情况在医生的指导下使用。头孢跟阿莫西林对孩子都是有一定影响的，如果还是在哺乳期的话，就尽量不要吃这些消炎药，这些对孩子的影响还是比较大的，因为阿莫西林和头孢都可以透过乳汁。所以两种药都会对宝宝有影响。注意事项及禁忌:多喝水，忌腥辣，注意休息。平时适当得运动增强体抗力，避免感冒。
阿莫西林的副作用不大，在临床上出现的几率也比较小。阿莫西林可出现以下五种副作用有，恶心、呕吐、腹泻，皮疹、药物热和哮喘等过敏反应，贫血、血小板减少，偶尔会出现兴奋、焦虑、失眠、头晕。
这也是一种抗生素药物，小孩子服用也会出现副作用的。如果过量的服用抗生素，会导致出现抗生素耐药性，也会导致出现一些二次感染的，比如真菌感染，念珠菌感染的也会导致出现一些口腔溃疡等相关疾病的。
