目前的这种输尿管肿瘤如果是良性的肿瘤，可以通过手术的方式来进行治疗。输尿管癌复发率较高，且有肿瘤种植及多中心生长的特点，术后应全身化疗、膀胱灌注化疗及定期膀胱镜复查。
输尿管肿瘤唯一的治疗金标准是半侧泌尿系切除，也就是输尿管癌治疗术，目前国内比较领先的技术是腹腔镜下的输尿管癌治疗术，且比较成熟，腹腔镜下一次手术成型，后期行随访治疗检查影像资料显示预后良好。术后需要2个月到半年定期做影像资料检查，或者行尿脱落细胞检查，如果均为阴性才比较安全，择期还需要行膀胱镜检查，膀胱镜下可以发现膀胱内比较隐蔽的病灶，这样不会漏诊。
采用中药配合治疗，见效快，疗效确切，许多使用后长期存活。药物配合使用能在短期内缩小肿块、控制转移扩散、减轻痛苦、稳定病情、延长生存期，提高生存质量，甚至达到临床治愈，有康复的可能。
输尿管肿瘤的治疗方法有保守治疗和手术治疗，具体采用哪种治疗方案需要具体情况来进行。如果没有出现转移的情况就可以采用手术切除肿瘤组织来进行治疗，如果已经转移则可能通过保守的治疗方法来，以提高生存期限。
输尿管肿瘤，要做整个肾脏输尿管全长和膀胱切除，左侧就做左侧膀胱，右侧就做右侧膀胱的部分切除，这样肿瘤的治疗就比较彻底。但是还是到正规的专科医院进行检查，根据自己的病情来选择合适的治疗方法，以达到良好的治疗目的并减少肿瘤复发的可能性，实现彻底康复。
若处于早期未出现远处的转移，则通过手术切除可彻底治愈，出现局部的转移，也可以通过扩大的根治手术来达到有效治疗的目的。若已出现远处转移，可以通过放疗或化疗的方法提高治疗效果，但晚期的输尿管癌不能完全治愈。输尿管癌应结合分期采取有效的治疗的方法，做到早发现，早治疗。