一般对于轻微的肛乳头瘤，在治疗的同时，可以配合中药灌肠治疗，以提高疗效，对于较大的肛乳头瘤，一般可以采取手术切除的治疗办法，在手术时，可以采用微创，来保护肛管皮肤。
乳头瘤本身是良性肿瘤，但肛门乳头瘤较寻常的乳头瘤更易癌变，需要尽早手术治疗，平时注意保暖，避免着凉。饮食上禁忌辛辣刺激性食物及生冷食物。继续注意多休息，保持大便通畅，清淡饮食，还有需要定期复查。
一般在一星期左右可以治好，如果确诊是肛乳头瘤建议的治疗办法就是手术治疗，至于恢复情况要根据本身身体素质来决定，术后定期复查，避免吃辛辣刺激性强的食物。要以清淡易消化的饮食为主。
早期治疗是预防肛肠疾患的关键，主要采用手术治疗，手术方法有：肛乳头瘤切除结扎术。冷冻疗法。电灼法：肛门部常规麻醉，在肛门镜下暴露出肛乳头瘤，用高频电灼探头按压在瘤体根部，开通电源，将乳头瘤彻底烧灼之。此法适合瘤体较小的病人，优点是操作方便，疗效可靠，一次可治疗几个乳头瘤。
肛乳头瘤怎么防止在于培养好的饮食和生活习惯。平时注意个人的饮食习惯，尽量不吃辛辣刺激的食物，多喝水，保持大便通畅，多吃一些五谷杂粮及蔬菜，禁烟酒，油腻过大食物。规律作息，不熬夜。