肛乳头瘤治疗最快方法是手术治疗，可以采取微创手术，可以做肠镜手术，手术中需要用麻醉，因此在手术中是感觉不到疼痛的。因为在做肠镜检查时一般不需要麻醉，所以会有明显的感觉，做手术不一样，会采取麻醉，不会有疼痛感的。
如肛乳头较大，一般主张手术治疗，与肛裂一齐处理。坐浴法：热水坐浴每日1-2次，局部热敷，改善血液循环促使炎症的吸收。使用药物涂以乳头上，可以治疗。平时要注意休息，多喝热水。
不要紧张可以保守治疗，勤观察，严重时再考虑手术。对早日可以不手术治疗，用中药灌肠效果比较好。也可以温水或药物坐浴，局部热敷可以改善血液循环，促进炎症吸收。用坐浴也不错。注意肛门卫生，便后及时清洁。饮食避免辛辣刺激，不能喝酒，千万别受凉。
对一些症状比较轻的病人，非手术疗法仍然是主要的治疗方法。瘤体较大或症状重者手术治疗。对早期疾病采用一些预防性的治疗，对不能手术的病人，在治疗的同时，配合中药灌肠治疗，以提高疗效。
肛乳头瘤治疗期为一周。在平时保持大便的通畅，并适当的多食一些含有纤维素的食物，以预防便秘，缓解肛门部位包块及痔疮的情况，若出现肛门部位疼痛加重时，可以选择手术治疗。
肛乳头瘤手术治疗比较好。病情相对比较复杂，也比较严重。保守治疗效果也不好，长期拖着反而会使病情加重。尽快行手术治疗，彻底治疗疾病。同时要注意保养、饮食宜清淡，忌食辛辣刺激食物，多吃含纤维素的食物，如蔬菜水果、香蕉、燕麦、荞麦、玉米面。戒烟戒酒。平时要保持肛门干燥清洁，养成良好的排便习惯，保持大便通畅。排便时间不宜过长。避免久站久坐。