肛乳头瘤是中医“脱肛”的一种，也是由于多由中气不足、病后及妇女生育过多，体质虚弱，或因便秘努责所致。临床上虽有虚实之分，但以虚者为多，实证较少。其病位在大肠，与肺、脾、胃、肾等脏腑有关。对于此病，中医提出了内，中医治疗以益气固脱为法，可予补中益气药物内服，以提升阳气。
肛乳头瘤治疗方法是保守治疗，勤观察，灌肠效果很好。可以温水或药物坐浴，局部热敷可以改善血液循环，促进炎症吸收。平时注意肛门卫生，便后及时清洗。吃东西要吃清淡无刺激的，多喝温水，不能喝酒。
手术治疗，可以采取微创手术，可以做肠镜手术，一般手术中需要用麻醉，因此在手术中是感觉不到疼痛的。因为在做肠镜检查时一般不需要麻醉，所以会有明显的感觉，做手术不一样，会采取麻醉，不会有疼痛感的。
肛乳头瘤治疗期为一周。在平时保持大便的通畅，并适当的多食一些含有纤维素的食物，以预防便秘，缓解肛门部位包块及痔疮的情况，若出现肛门部位疼痛加重时，可以选择手术治疗。
肛乳头瘤是一种良性肿瘤，中医治疗的效果还是很不错的。很多时候会选用一些皮表的处理方法，比如激光，去除多余的增生部位。但是治标不治本，病因仍然没有解决。中医里面主要是以调理为主，增强自身的免疫力，防止细菌的侵害，常用清热利湿解毒等方法。