去除乳腺囊肿的方法主要有服药疗法和手术疗法两种。
一般来说，乳腺囊肿还没有2cm的时候，可以考虑使用药物进行治疗,用中药或者中成药都是对较好的，当乳腺囊肿到达2-5cm时候可以采用抽取囊液的方法进行治疗，当在乳腺囊肿大于5cm时后,可以采用微创手术的方法进行治疗。
建议患者需要规律生活，保持心情舒畅，养成良好的运动习惯。
乳腺囊肿可以通过手术或病理穿刺来治疗。
由于乳腺囊肿是乳腺的良性肿瘤。通过手术切除，是可以完整的切除，不会引起复发或其他病变。而穿刺治疗适用于不宜手术切除的病例，也是有治疗作用的。
建议患者在日常生活中注重个人的饮食，不要食用生冷、辛辣等食物，多吃新鲜蔬菜，饮食清淡，禁烟禁酒，注重锻炼，保持愉悦心情。
左乳腺囊肿可以选择手术切除囊肿，也是有一定的复发率。如果囊肿生长部位不影响病人生活，也可以不做处理。早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除。
乳腺囊肿通常不会消失。乳腺良性病变，一旦发现应考虑手术切除。乳腺囊肿主要是由于内泌紊乱引起导管上皮增生，管内细胞增多，致使导管延伸、迂曲、折叠，折叠处管壁因缺血而发生坏死，形成囊肿。乳腺囊肿常见的有单纯囊肿、积乳囊肿等。单纯囊肿在乳腺囊肿中最为多见。
乳腺囊肿并不能够自已消失的，因为一旦是囊肿存在后，即属于异常的增生现象，这样的增生是在乳腺内部处的生长迹象，并不会说因为饮食作息甚至激素方面的调整就会自行消退。反而容易受到身体的一些变化而引起生长。