有时在做B超的时候，会发现有一个囊肿，患者会很紧张，不知道会不会有危险，需要对囊肿进行进一步的观察，最好的方法是三个月复查。同时还要检查囊肿是否大，是否有压迫感。比如说，压迫到了甲状腺组织，压迫到了颈部的血管，患者会感觉到不适，如果囊肿生长的太快，就必须要做手术，如果囊肿向外生长，形成一个包在脖子上，会很影响美观。有些特殊的职业，可能会选择外科。同时还要检查囊肿边缘有没有毛刺，里面有没有钙化。
甲状腺囊肿多为良性。甲状腺癌合并囊肿少见，约1%~2%，癌性囊肿、囊液细胞学检查通常可见癌细胞。曾用手术治疗甲状腺囊肿，多切除囊肿。
手术操作造成的骨肿瘤疤痕，影响美观，有一定的并发症。目前多主张穿刺抽取和注射硬化剂治疗。这些固化剂能使囊壁发生无菌性坏死，阻止囊肿生成，使囊壁粘连，达到治疗纤维化、囊肿堵塞、囊肿的目的。该治疗对薄壁囊肿效果最好，有效率达94%。厚壁囊肿疗效差。厚壁囊肿实变肿块与周围组织无明显边界，囊肿内容物血性，反复抽吸后快速积聚，应警惕癌变可能，宜采用手术治疗。术中病理活检为恶性肿瘤，按甲状腺癌处理。
有甲状腺囊肿可以使用药物治疗、手术治疗等，具体分析如下：
1.药物治疗：进行穿刺引流后医生可能会根据患者的甲状腺功能情况，给予患者一些药物（如甲状腺素），以帮助患者恢复，防止囊肿复发。
2.手术治疗：如果患者病情严重，且有脖子肿大、憋气、吞咽困难、声音沙哑等症状的时候，可以采取甲状腺穿刺引出囊液，缓解症状。对于穿刺引流无效、反复发作或疑似癌变者，医生可能会建议手术切除。
甲状腺囊肿是一种良性病变，但是如果压迫了颈部组织，可能会出现颈部不舒服，所以对身体是有一定影响的。需要去做个详细检查，如果是有甲状腺囊肿，需要用手术切除甲状腺治疗比较好，然后排除甲亢或者甲减的发生，然后针对性的治疗。
甲状腺滤泡囊肿治疗首先不要吃脂肪含量过高，也不要吃辛辣、刺激性食物，饮食注意清淡，多做一些体育运动，如:跑步，打球，长期坚持可得到改善，也可以通过手术切除或者化疗来进行治疗。
近年来，随着生活水平、节奏、压力的增高，发现甲状腺结节的人越来越多，多为甲状腺胶质囊肿，超声下表现为囊性结节，中间可见称为胶质晶体的亮点。这类疾病不需要特别的治疗。其实是生理状态的反应，所以不需要太多的医疗干预。但是，超声波诊断多被解释为结节内的钙化灶，有时会被误认为是甲状腺恶性肿瘤。
因此，对于甲状腺神经胶质囊肿，首先要做出正确的判断，如果确定甲状腺神经胶质囊肿不予治疗，只需给予临床观察。对于甲状腺胶质囊肿，患者应减轻心理压力，在此过程中主要定期观察。胶质囊肿生长缓慢，每年行一次超声检查即可，如无增大趋势，生活方式调整有缩小趋势，可能消失，为可逆性病变。