先天性贫血治疗起来首先就是要找到病因，看具体是什么原因引起的，例如地中海贫血以及先天性再生障碍性贫血。先天性贫血治疗起来比较困难，一般如果是想要彻底治疗，只能够换血或者是换骨髓。
先天性贫血认为是有地中海贫血，是一种遗传性疾病。发生先天性贫血后会出现面色苍白，或者是萎黄，头晕乏力，精神不振，需要到医院做个确诊，如果是地中海贫血，药物治疗，如果是贫血很严重需要输血治疗。平时饮食也要加强营养，注意多吃猪肝，猪血，鸡血，鸭血，海带，木耳等食品，也可以服用阿胶浆。
小儿先天性红细胞生成异常性的贫血，是一种非常少见的以红细胞系无效造血为特征的遗传性的疾病。
小儿先天性红细胞生成异常性的贫没有特效的治疗方法，一般输注浓缩红细胞是唯一纠正贫血的方法，必要的时候可以切脾。小儿先天性红细胞生成异常性的贫血的临床表现，一般是出现贫血的面容，伴有持续或者是间断性的黄疸，生殖系统损伤，呼吸困难，心脏病、急性肾功能衰竭等症状，且继发感染的可能性大。
平时的饮食方面需要均衡饮食，多吃一些含铁、叶酸和维生素b12的食物。
药物治疗血容性贫血。如果是由外来因素引起的，一般可以去除。如因食用蚕豆或接触药物、毒物而引起的溶血性贫血，应该停止接触这类物品。如血型不合或污染引起的输血反应，应立即停止输血。可以预防的致病原因，预防比治疗更为重要。
先天性贫血是由于红细胞中血红蛋白的合成发生了障碍而致的溶血性贫血，根据病情的轻重不同各自又分为轻型和重型，如果两个患同类的轻型地中海贫血的青年结婚，则有1／4的机会生出一个重型的患儿，目前对地中海贫血最有效的办法是进行产前诊断，以防止重症患儿的出生。
长期缺铁性贫血要采取药物治疗，引起缺铁性贫血的原因主要是摄入不足、丢失过多。治疗方式还有就是调整饮食，平时要均衡饮食，不可挑食，多吃瘦肉、动物肝脏、花生等食品。