补体C4偏低最常见的为系统性红斑狼疮，该病可累及多个系统，最常受累的为肾脏，表现为肾炎综合征、肾病综合征或肾功能衰竭，除肾脏表现外，还可出现面部皮疹、关节疼痛、口腔溃疡、脱发、胸闷、气短等症状。
补体C4的降低常见于，遗传性血管性水肿、急性肾小球肾炎、慢性活动性肝炎、IgA肾病。在系统性红斑狼疮病人中，补体C4的降低往往最早出现，恢复至正常水平所需要的时间也较长。
单纯补体C4偏低，并不能说明患有某种疾病，必须结合风湿免疫科相关其他检查结果，还要结合临床症状、体征等综合因素做出最终的判断。如果出现了补体C4降低，说明疾病处于活跃期，疾病活动消耗了大量的补体。
补体C3偏低可见于消耗增加，最常见细菌或病毒的感染，但也要警惕某些免疫系统疾病，系统性红斑狼疮、血清病、肾炎、肾病综合征、肝病、关节炎等，一旦有相关异常表现，需要及时就诊，早期发现，早期治疗。
补体C3减少见于脂肪代谢障碍、肾炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等疾病，补体C4减少多见于遗传性血管神经性水肿、类风湿性关节炎、自身免疫性溶血性贫血、系统性红斑狼疮等。
血清补体C3C4偏低，如患者有乙型肝炎病史，随着肝炎活动的增加，血清补体C3C4水平可降低。补体是一组具有酶活性的糖蛋白，是机体重要的免疫效应系统之一，C3C4是补体系统中最为重要的，而肝脏是人体免疫因子来源最多的器官，在发生肝细胞损伤后可使补体C3C4下降。