会厌囊肿有可能会自己消失的。这种疾病往往是在体检的时候偶然发现的。一般不会有任何的症状，所以不需要特殊治疗，平时不要吃过硬的食物，不要吃过热的食物，注意保暖，避免感冒，尽量不要抽烟饮酒就可以。
会厌囊肿是一种良性病变，只要没有症状一般不用治疗，如果囊肿比较大的话，则需要考虑手术治疗，有些囊肿有可能会自己破。一般这个是没有什么关系的，如果是破裂之后自然是会从阴道排泄出来的，所以是没有什么多大的关系的。
局麻下手术的病人几乎没有痛苦，保持清醒状态，一般术后两小时就没什么不适。但是对于全麻下用激光或射频治疗的病人，可能在术后一周内出现咽部的疼痛。会厌囊肿手术治疗的方法要根据会厌囊肿的部位和大小来决定。对于较小的囊肿，在门诊喉镜下用活检钳把黏膜瓣挑开，把水放出来。容易复发，用针挑掉后可能再次出现。另一个比较彻底治疗方法是在全麻下、显微镜扩大倍数的情况下，用激光或射频把囊肿完整地切除。
会厌囊肿术后会引起出血。
会厌囊肿是喉囊肿的一种，常用的手术方式有二氧化碳激光、低温等离子刀以及传统的手术方式，术后需要避免感冒，以免引起手术创面的充血肿胀，导致呼吸不畅、异物感，甚至出血的可能；饮食上需清淡、软饮食，避免刺激或刮伤创面，造成感染和出血的发生。
建议去耳鼻喉科做喉镜检查，根据检查结果确定后遗症，术后避免进食坚硬食物及辛辣刺激食物，适宜进食半流软食，以免进食硬物刮伤创面。
如果采用本手术的费用，检查费约需1000元左右，等离子刀费用以及手术费大约5000元，术后的护理费、药费大约1000元左右，全部的总费用基本在7000~8000元。
会厌囊肿手术目前多采用全麻支撑喉镜下等离子刀会厌囊肿切除手术，这种手术是一种微创的手术，手术的效果非常好。这种手术的费用包括术前检查费800-1000元左右，还有手术费用，手术费用基本上在2000元左右，还有包括等离子刀费用可能需要2000-3000元左右。另外，包括术后用药的费用大约在1000元左右，全部加起来的费用基本上在7000-8000元左右。各地会有差异，但是大致费用基本上就这些，如果医保能报销，自己付1000-2000元左右。
会厌囊肿要注意个人的卫生，保持口腔清洁，饮食上也要注意不要吃辛辣，过硬过冷的食物，饮食上可以多吃一些软糯易消化的流质食物，避免抽烟喝酒，保持规律的作息习惯，早睡早起，晚上避免熬夜，平时可以进行适当的锻炼，增强自身的免疫力。