一般来说，脑部脊索瘤的症状是头疼、动眼神经、滑车神经等症状。具体分析如下：
脊索瘤是一种来源于胚胎时期残留或迷走的脊索组织的低度恶性的先天性肿瘤。脑脊索瘤主要是指发生在颅内的脊索瘤，大部分患者可能会出现头疼的症状。鞍区附近的脊索瘤可出现动眼神经、滑车神经等症状。患者可以通过伽马刀放射治疗、手术等方式进行治疗。
脊索瘤的前期症状包括有头痛，食欲下降等，不能掉以轻心，一定要在医院检查清楚，然后及时的进行治疗，听从医生的嘱咐，建议先配合药物共同治疗，来控制住病情，还有要注意营养合理，多吃高蛋白、易消化的食物及新鲜水果、蔬菜，多注意休息。
骶骨脊索瘤症状也会有臀部疼痛，下肢抽痛，麻木，阳痿，身体肥胖等，骶骨脊索瘤这个疾病是非常严重的，而且症状也是非常明显的。对于骶骨部位的脊索瘤，往往肿瘤已经生长的体积非常的巨大，对周围的组织血管神经造成了明显的侵犯。多数可能会出现一定的运动功能。
斜坡脊索瘤发展到最后，出现，头痛，呕吐，颅内压增高，后组颅神经损伤，吞咽困难，咳嗽无力，流口水，讲话困难，也可能出现面瘫，耳鸣或失聪，严重的影响呼吸，出现呼吸困难，心脏骤停。
手术以后出现明显的脑组织水肿的情况。出现剧烈的头痛头昏，并且颅内压增高，另外有一些脊索瘤术后可能会出现脑脊液漏的情况，脊髓瘤由于其位置较深，想做到手术尽可能最大切除，有可能会造成手术破坏较为广泛。
颅内脊索瘤有如下症状，力减退，眼睑下垂，眼球运动受限，复视，面部麻木等。部分病人有垂体功能的低下，后颅底可出现面瘫，吞咽困难，饮水呛咳，构音障碍，言语不清等。后期可引起颅内高压，偏瘫、行走不稳。