咽下困难进行性咽下困难是绝大多数患者就诊时的主要症状，但却是本病的较晚期表现。因为食管壁富有弹性和扩张能力，只有当约2/3的食管周径被癌肿浸润时，才出现咽下困难。因此，在早期症状出现后，在数月内病情逐渐加重，由不能咽下固体食物发展至液体食物亦不能咽下。
贲门癌晚期随着病情的进展，临床表现多种多样。由于贲门属于胃入口，该区域发生病变，可以引起梗阻，严重时出现不能进食、进水，在临床上贲门癌晚期多以消耗为主要表现，出现恶病质，常处于饥饿的状态。肿瘤穿透可引起穿孔、破溃引起大出血，甚至死亡。
早期贲门癌是没有什么明显的症状。即使有一些症状也和普通的上消化道疾病，比如胃炎、胃溃疡、反流性食管炎的表现，比如腹胀、隐痛、嗳气等没有明显的区别。中晚期的贲门癌，临床症状和食管癌比较相似，典型的表现就是进行性吞咽困难。
贲门癌的主要症状是出血，可以引起黑便或者是呕血，另外可以导致疼痛症状，特别是出现在胸骨的后方，以及肩胛骨位置出现长时间的钝痛，除此之外，还影响到进食，导致吞咽困难，体重下降。
贲门癌晚期症状不一样，最终因为这种疾病去世的表现形式也是多种多样。出现一些合并症，比如出血或穿孔，还有肿瘤导致的梗阻，导致进食困难，这样会逐渐消瘦，营养消耗比较严重，最终出现多器官的功能衰竭，就是心肝肺肾功能慢慢衰竭。
由于贲门癌位于食管的末端病人晚期呕吐的症状多较食管癌明显，呕吐量也比较大，有时有隔夜的素食或腐臭味，贲门癌的体重减轻以及恶病质的表现多较食管癌轻，而且出现比较晚。